Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r80L7N1Z3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms