Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms