Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccer2J3QPU5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccer2J3QPU5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccer2J3QPU5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms