Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5294J3QP53 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm5294J3QP53 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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