Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21900J3QP38 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm21900J3QP38 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21900J3QP38 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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