Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim18J3QNP2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Smim18J3QNP2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms