Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm17577J3QNF7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm17577J3QNF7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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