Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ccdc180J3QNE4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc180J3QNE4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc180J3QNE4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms