Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21972J3QN38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm21972J3QN38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms