Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn20G5E8X0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn20G5E8X0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn20G5E8X0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn20G5E8X0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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