Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp6G5E8P0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tubgcp6G5E8P0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms