Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp17ldG5E8G2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp17ldG5E8G2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms