Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b1G5E829 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp2b1G5E829 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp2b1G5E829 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms