Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf148G3X9R7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf148G3X9R7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms