Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hmgxb3G3X9M3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hmgxb3G3X9M3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms