Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4933408B17RikG3X9B4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4933408B17RikG3X9B4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933408B17RikG3X9B4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933408B17RikG3X9B4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933408B17RikG3X9B4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933408B17RikG3X9B4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4933408B17RikG3X9B4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms