Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmigd3G3X8R9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms