Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r167G3UW71 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r167G3UW71 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r167G3UW71 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms