Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34aG3UW52 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn34aG3UW52 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms