Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ScaperF8VQ70 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ScaperF8VQ70 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms