Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
5830473C10RikF8VQ07 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
5830473C10RikF8VQ07 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms