Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M1F7CXU4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M1F7CXU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms