Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm340F6RGI3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm340F6RGI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm340F6RGI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms