Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp17lbE9Q9U0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp17lbE9Q9U0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp17lbE9Q9U0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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