Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc146E9Q9F7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms