Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Simc1E9Q6E9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Simc1E9Q6E9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Simc1E9Q6E9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms