Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FancfE9Q5Z5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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FancfE9Q5Z5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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FancfE9Q5Z5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FancfE9Q5Z5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FancfE9Q5Z5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FancfE9Q5Z5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FancfE9Q5Z5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FancfE9Q5Z5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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