Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb9E9Q5G2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb9E9Q5G2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms