Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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ApobE9Q414 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ApobE9Q414 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ApobE9Q414 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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ApobE9Q414 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ApobE9Q414 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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ApobE9Q414 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ApobE9Q414 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ApobE9Q414 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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