Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup153E9Q3G8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup153E9Q3G8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms