Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r238E9Q373 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r238E9Q373 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r238E9Q373 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms