Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc171E9Q1U1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms