Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms