Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt78E9Q0F0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt78E9Q0F0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms