Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx60E9PZQ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx60E9PZQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx60E9PZQ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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