Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf11E9PZM7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf11E9PZM7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms