Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srp54bE9PXC0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srp54bE9PXC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms