Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl3lE9PWZ3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl3lE9PWZ3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl3lE9PWZ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms