Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zscan18E9PUD6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zscan18E9PUD6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms