Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Piezo1E2JF22 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Piezo1E2JF22 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Piezo1E2JF22 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Piezo1E2JF22 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Piezo1E2JF22 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Piezo1E2JF22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms