Protein–RNA interactions for Protein: D3YZF6

Fam205a1, Family with sequence similarity 205, member A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205a1D3YZF6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205a1D3YZF6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205a1D3YZF6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam205a1D3YZF6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam205a1D3YZF6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam205a1D3YZF6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms