Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samd1D3YXK1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samd1D3YXK1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms