Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp27D3YV89 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp27D3YV89 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms