Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ube2d4D3YUH6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ube2d4D3YUH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms