Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptprz1B9EKR1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ptprz1B9EKR1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms