Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmf1B9EKI3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmf1B9EKI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms