Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdzd8B9EJ80 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd8B9EJ80 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd8B9EJ80 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms