Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syce3B5KM66 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syce3B5KM66 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms