Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11cB4XVP9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11cB4XVP9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms