Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr3aB2RXC6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr3aB2RXC6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr3aB2RXC6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms